Baseada na suposta história real da Maldição da Mansão Himuro – um dos casos mais macabros e perturbadores já registrados no Japão –, Crimson House acompanha a trajetória dos gêmeos Saori e Takeru Miyazaki, ambos estudantes de 17 anos, que se mudaram de Kyoto para uma nova casa em Tóquio, adquirida pelos pais. Aos 16 anos, Takeru envolveu-se com tráfico de drogas e foi enviado para um colégio interno em Hong Kong. Ele retorna ao Japão um ano depois, para viver novamente com a família. Apesar de serem gêmeos, Takeru nunca teve uma boa relação com sua irmã Saori, o que contribuiu para o afastamento entre ambos. Com o tempo, uma série de eventos estranhos começa a ocorrer dentro da mansão. Nessa disputa, Saori terá que descobrir sozinha os segredos ancestrais daquela casa e entender como sua família foi parar ali. Além disso, ela precisa proteger a irmã mais nova, Kato, de sete anos, que insiste em afirmar que um fantasma a assombra em seu quarto todas as noites.