Naruto Uzumaki e seu time embarcam em um novo desafio, enfrentando a sinistra organização Akatsuki para salvar Gaara, o líder da Vila da Areia.

O ninja de Konoha retornou, mas Naruto deve encontrar um novo membro para a equipe quando Kakashi for hospitalizado. Eles vão até a ponte Tenchi para encontrar um espião.

Kakashi tem um novo programa de treinamento para Naruto, que vem tendo pesadelos com a raposa demônio. A equipe encontra Sora, um monge com um passado perturbador.

A Akatsuki está de novo em movimento, procurando pelos anfitriões das bestas com cauda. Naruto continua o treinamento e aprende qual é seu verdadeiro propósito.

Konoha, Akatsuki e a equipe Guren trabalham para capturar o Três Caudas e selá-lo em sua própria dimensão. As habilidades de um jovem órfão podem ser a chave para isso.

Sasuke, cada vez mais poderoso, se prepara para confrontos com seu mentor e seu irmão, e a equipe de Naruto descobre um misterioso jutsu proibido.

A inveja que Sasuke sente de Naruto causa problemas. O Time 7 e o Time 10 se unem para ajudar um vilarejo, e uma verdade surpreendente vem à tona.

O encontro fatídico de Danzo e Sasuke termina em sangue. A vida de Sakura corre risco, e Naruto interfere.

À beira da Quarta Guerra Mundial Ninja, Anko cai nas mãos erradas ao espiar o quartel da Akatsuki.

Lutando em lugares diferentes, Sakura, Shikamaru e Kiba encontram um garoto estranho, capaz de controlar o clima. E parece que ele já conhece essa turma.

A Quarta Guerra Mundial Shinobi acabou, e Kakashi foi nomeado o Sexto Hokage. Agora, os moradores da Vila Oculta da Folha se preparam para uma nova era.

Sem saber a verdade sobre a Quarta Guerra Mundial Shinobi, Naruto é confinado a uma ilha secreta onde treina para controlar sua Raposa de Nove Caudas.

Naruto entra na guerra e parte para o combate, mas não vai ser fácil derrotar Tobi e o Zetsu branco controlado por ele.

A Quarta Guerra Mundial Shinobi continua e um clima estranho causa estragos no campo de batalha.

Kabuto revive uma força avassaladora na forma de Madara, que começa a perseguir Naruto para recuperar Kyubi. Seu objetivo? Recuperar a raposa demônio de nove caudas.