A história acompanha a vida de Yukito Yanagi, um órfão que acaba por conhecer um discípulo excêntrico de seu pai. Este estranho homem o leva para Ayaka, um arquipélago de 7 ilhas que é a terra natal de Yukito. Dizem os rumores que, em Ayaka, moram dragões e outros seres misteriosos conhecidos como "Mitama". Lá, Yukito conhece os outros dois discípulos de seu pai, responsáveis por manter a harmonia em Ayaka... Uma harmonia que pode não durar muito tempo.